Jumeaux numériques pour l’évaluation et l’optimisation organisationnelle des plateformes de séquençage à très haut débit

Rattachement
Centre Ingénierie et Santé, Ecole des Mines Saint-Etienne
Description

INGENIEUR(E) DE RECHERCHE

 Jumeaux numériques pour l’évaluation et l’optimisation organisationnelle des plateformes de séquençage à très haut débit

 Encadrement : Xiaolan Xie, Vincent Augusto, Lionel Perrier
Laboratoire : Centre Ingénierie et Santé, Ecole des Mines Saint-Etienne
Spécialité scientifique : Génie industriel/Recherche opérationnelle
Durée : 12 mois renouvelable deux fois

Démarrage : Le plus tôt possible

SUJET

A l’issue de la procédure d’appel d’offre du plan France médecine génomique 2025, deux premières plateformes, Seqoia (Ile de France) et Auragen (Auvergne Rhône Alpes), ont été sélectionnées pour déployer les tests de séquençage à très haut débit dans les maladies rares et en cancérologie. Les projets d’évaluation médicale et économique de l’organisation pilote proposés par chacune de ces plateformes, qui avaient été initialement élaborés de manière indépendante, ont été réunis en un seul projet conduit par six équipes de recherche. Ce projet d'évaluation commun vise à répondre à l’objectif 3 du Plan France Médecine Génomique (PFMG) 2025 ( https://pfmg2025.aviesan.fr/). Il tient compte des projets d’évaluation initiaux de l’organisation pilote de chaque plateforme, des attentes de la DGOS, de la HAS et de la CNAM qui ont été précisées dans le cadre de la mesure 12 du PFMG, des pré-indications déjà retenues dans le domaine des maladies rares, du cancer et des prédispositions au cancer, ainsi que des projets pilotes initiés.

Le projet d’évaluation médicale et économique comprend trois work packages (WP) complémentaires portant sur l’estimation des coûts de production et l’évaluation organisationnelle (WP1), les indicateurs de performance des plateformes et l’impact du séquençage génomique à très haut débit sur le parcours de soins (WP2), l’évaluation de l’efficience et la production de modèles économiques et de tarification (WP 3).

La recherche de l’ingénieur(e) de recherche s’inscrit principalement dans le cadre du WP1 et est dédiée à l’évaluation organisationnelle. L’évaluation organisationnelle repose sur le développement d’un outil d’aide à la décision sous la forme d’un jumeau digital générique pour la simulation de flux des plateformes. Cet outil permet de procéder à une analyse opérationnelle (identification des goulots d’étranglement dans le flux d’échantillons et le parcours patient), une analyse de risques (identification des étapes sensibles dans la mise en œuvre et l’utilisation des plateformes) mais également et une analyse structurelle (identification des défaillances potentielles dans le parcours modélisé) et de capturer l’ensemble des caractéristiques du parcours de prise en charge des patients. Les durées de traitement d’un échantillon de la prescription au retour des résultats, les cadences d’utilisation des plateformes, les charges de travail des ressources humaines, seront notamment évaluées.  Par ailleurs,  ce modèle de simulation à événements discrets permettra d’évaluer les besoins en ressources en fonction des objectifs en termes de cadences et du temps de cycle de séquençage, et d’aider à la décision des scénarios organisationnels des plateformes.

L’ingénieur(e) de recherche contribuera également à l’évaluation de l’efficience du WP3. Le modèle de simulation à événements discrets développé dans le WP1 peut être étendu pour une simulation des parcours de patient sur un horizon temporel long. Les résultats de simulation, couplés avec des données de qualité de vie issues de la littérature, permettent des analyses coût-efficacité et coût-utilité.

PROFIL DU CANDIDAT

Titulaire d’un doctorat avec de solides connaissances en génie industriel (modélisation d’entreprise, simulation de flux, évaluation de performances), en recherche opérationnelle (modélisation mathématique, optimisation), et en informatique (programmation en C/C++, statistiques, optimisation). Il est apte à travailler dans une équipe pluridisciplinaire. L’expérience en organisation des soins est un plus.

COMMENT CANDIDATER

Envoyer CV, lettre de motivation, lettres de recommandation, cinq publications/thèse à xie@emse.fr en prévision d’un entretien.

Type